Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BEX3Q00994 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BEX3Q00994 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms