Protein–RNA interactions for Protein: Q00604

NDP, Norrin, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDPQ00604 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDPQ00604 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NDPQ00604 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NDPQ00604 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDPQ00604 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NDPQ00604 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDPQ00604 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDPQ00604 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDPQ00604 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDPQ00604 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDPQ00604 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDPQ00604 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDPQ00604 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDPQ00604 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDPQ00604 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDPQ00604 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDPQ00604 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDPQ00604 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDPQ00604 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDPQ00604 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDPQ00604 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDPQ00604 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDPQ00604 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDPQ00604 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDPQ00604 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDPQ00604 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDPQ00604 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDPQ00604 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NDPQ00604 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDPQ00604 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NDPQ00604 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDPQ00604 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDPQ00604 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDPQ00604 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDPQ00604 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDPQ00604 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDPQ00604 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDPQ00604 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDPQ00604 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDPQ00604 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDPQ00604 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDPQ00604 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDPQ00604 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDPQ00604 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDPQ00604 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDPQ00604 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDPQ00604 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDPQ00604 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDPQ00604 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDPQ00604 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDPQ00604 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDPQ00604 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDPQ00604 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDPQ00604 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDPQ00604 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDPQ00604 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDPQ00604 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDPQ00604 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NDPQ00604 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NDPQ00604 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDPQ00604 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDPQ00604 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDPQ00604 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDPQ00604 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDPQ00604 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDPQ00604 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDPQ00604 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDPQ00604 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDPQ00604 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDPQ00604 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NDPQ00604 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NDPQ00604 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NDPQ00604 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NDPQ00604 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
NDPQ00604 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NDPQ00604 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NDPQ00604 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NDPQ00604 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NDPQ00604 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NDPQ00604 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NDPQ00604 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NDPQ00604 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NDPQ00604 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NDPQ00604 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NDPQ00604 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NDPQ00604 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NDPQ00604 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NDPQ00604 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NDPQ00604 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NDPQ00604 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NDPQ00604 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NDPQ00604 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NDPQ00604 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NDPQ00604 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NDPQ00604 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NDPQ00604 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NDPQ00604 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NDPQ00604 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NDPQ00604 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NDPQ00604 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms