Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FANCCQ00597 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FANCCQ00597 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FANCCQ00597 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FANCCQ00597 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FANCCQ00597 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FANCCQ00597 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FANCCQ00597 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FANCCQ00597 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FANCCQ00597 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FANCCQ00597 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FANCCQ00597 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FANCCQ00597 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FANCCQ00597 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FANCCQ00597 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FANCCQ00597 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FANCCQ00597 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FANCCQ00597 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FANCCQ00597 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FANCCQ00597 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FANCCQ00597 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FANCCQ00597 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FANCCQ00597 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FANCCQ00597 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FANCCQ00597 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FANCCQ00597 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FANCCQ00597 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FANCCQ00597 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FANCCQ00597 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FANCCQ00597 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FANCCQ00597 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FANCCQ00597 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FANCCQ00597 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FANCCQ00597 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FANCCQ00597 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FANCCQ00597 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FANCCQ00597 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FANCCQ00597 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms