Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED6P86452 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED6P86452 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED6P86452 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED6P86452 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED6P86452 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED6P86452 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED6P86452 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED6P86452 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED6P86452 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED6P86452 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED6P86452 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED6P86452 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED6P86452 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED6P86452 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZBED6P86452 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZBED6P86452 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZBED6P86452 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZBED6P86452 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZBED6P86452 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZBED6P86452 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZBED6P86452 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZBED6P86452 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZBED6P86452 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZBED6P86452 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZBED6P86452 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZBED6P86452 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZBED6P86452 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED6P86452 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED6P86452 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED6P86452 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED6P86452 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED6P86452 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED6P86452 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED6P86452 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED6P86452 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED6P86452 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED6P86452 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED6P86452 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED6P86452 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED6P86452 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED6P86452 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED6P86452 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED6P86452 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED6P86452 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED6P86452 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED6P86452 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED6P86452 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED6P86452 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED6P86452 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED6P86452 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZBED6P86452 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZBED6P86452 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZBED6P86452 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZBED6P86452 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZBED6P86452 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZBED6P86452 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZBED6P86452 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZBED6P86452 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZBED6P86452 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZBED6P86452 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZBED6P86452 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZBED6P86452 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms