Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CBX1P83916 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CBX1P83916 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CBX1P83916 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CBX1P83916 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CBX1P83916 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CBX1P83916 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBX1P83916 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBX1P83916 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBX1P83916 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBX1P83916 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBX1P83916 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBX1P83916 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBX1P83916 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBX1P83916 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBX1P83916 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBX1P83916 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBX1P83916 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBX1P83916 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBX1P83916 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBX1P83916 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBX1P83916 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBX1P83916 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBX1P83916 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBX1P83916 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBX1P83916 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBX1P83916 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBX1P83916 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBX1P83916 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBX1P83916 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CBX1P83916 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CBX1P83916 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CBX1P83916 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CBX1P83916 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CBX1P83916 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CBX1P83916 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CBX1P83916 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CBX1P83916 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CBX1P83916 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CBX1P83916 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CBX1P83916 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CBX1P83916 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CBX1P83916 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CBX1P83916 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CBX1P83916 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CBX1P83916 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CBX1P83916 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CBX1P83916 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CBX1P83916 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CBX1P83916 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBX1P83916 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBX1P83916 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBX1P83916 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBX1P83916 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBX1P83916 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBX1P83916 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBX1P83916 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBX1P83916 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBX1P83916 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBX1P83916 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBX1P83916 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBX1P83916 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBX1P83916 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBX1P83916 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBX1P83916 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBX1P83916 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBX1P83916 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBX1P83916 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBX1P83916 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBX1P83916 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBX1P83916 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBX1P83916 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBX1P83916 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBX1P83916 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBX1P83916 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBX1P83916 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBX1P83916 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBX1P83916 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBX1P83916 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBX1P83916 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBX1P83916 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBX1P83916 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBX1P83916 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBX1P83916 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBX1P83916 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBX1P83916 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBX1P83916 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBX1P83916 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CBX1P83916 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CBX1P83916 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CBX1P83916 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CBX1P83916 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CBX1P83916 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CBX1P83916 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CBX1P83916 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CBX1P83916 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CBX1P83916 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CBX1P83916 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CBX1P83916 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CBX1P83916 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms