Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GTF2IP78347 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTF2IP78347 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms