Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVFC1P60507 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ERVFC1P60507 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ERVFC1P60507 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVFC1P60507 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVFC1P60507 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVFC1P60507 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVFC1P60507 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVFC1P60507 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVFC1P60507 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVFC1P60507 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVFC1P60507 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVFC1P60507 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVFC1P60507 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVFC1P60507 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVFC1P60507 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVFC1P60507 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVFC1P60507 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVFC1P60507 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVFC1P60507 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVFC1P60507 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms