Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MCCD1P59942 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms