Protein–RNA interactions for Protein: P55072

VCP, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPP55072 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VCPP55072 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VCPP55072 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VCPP55072 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VCPP55072 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VCPP55072 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VCPP55072 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VCPP55072 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VCPP55072 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VCPP55072 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VCPP55072 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VCPP55072 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VCPP55072 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VCPP55072 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VCPP55072 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VCPP55072 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VCPP55072 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VCPP55072 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VCPP55072 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VCPP55072 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VCPP55072 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VCPP55072 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VCPP55072 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VCPP55072 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VCPP55072 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VCPP55072 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VCPP55072 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
VCPP55072 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
VCPP55072 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VCPP55072 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VCPP55072 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VCPP55072 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VCPP55072 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VCPP55072 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VCPP55072 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VCPP55072 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VCPP55072 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VCPP55072 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VCPP55072 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VCPP55072 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VCPP55072 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VCPP55072 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VCPP55072 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VCPP55072 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VCPP55072 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VCPP55072 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VCPP55072 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VCPP55072 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VCPP55072 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22■■□□□ 1.11
VCPP55072 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VCPP55072 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VCPP55072 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
VCPP55072 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
VCPP55072 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
VCPP55072 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VCPP55072 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VCPP55072 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VCPP55072 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VCPP55072 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VCPP55072 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCPP55072 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCPP55072 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCPP55072 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCPP55072 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCPP55072 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCPP55072 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCPP55072 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCPP55072 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCPP55072 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VCPP55072 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VCPP55072 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCPP55072 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCPP55072 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCPP55072 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCPP55072 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCPP55072 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCPP55072 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCPP55072 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCPP55072 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCPP55072 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCPP55072 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCPP55072 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCPP55072 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCPP55072 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCPP55072 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCPP55072 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCPP55072 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCPP55072 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCPP55072 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCPP55072 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCPP55072 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCPP55072 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCPP55072 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCPP55072 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
VCPP55072 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCPP55072 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
VCPP55072 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
VCPP55072 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCPP55072 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCPP55072 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.2 ms