Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLTPP55058 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLTPP55058 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLTPP55058 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLTPP55058 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLTPP55058 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLTPP55058 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLTPP55058 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLTPP55058 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLTPP55058 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLTPP55058 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLTPP55058 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PLTPP55058 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLTPP55058 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLTPP55058 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLTPP55058 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLTPP55058 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PLTPP55058 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLTPP55058 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLTPP55058 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLTPP55058 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLTPP55058 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLTPP55058 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLTPP55058 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLTPP55058 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLTPP55058 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLTPP55058 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLTPP55058 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLTPP55058 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLTPP55058 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLTPP55058 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLTPP55058 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLTPP55058 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLTPP55058 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLTPP55058 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLTPP55058 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PLTPP55058 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLTPP55058 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLTPP55058 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLTPP55058 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLTPP55058 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLTPP55058 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLTPP55058 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLTPP55058 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLTPP55058 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLTPP55058 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLTPP55058 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLTPP55058 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLTPP55058 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLTPP55058 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLTPP55058 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLTPP55058 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLTPP55058 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLTPP55058 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLTPP55058 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLTPP55058 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLTPP55058 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLTPP55058 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLTPP55058 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLTPP55058 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLTPP55058 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLTPP55058 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLTPP55058 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLTPP55058 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PLTPP55058 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLTPP55058 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLTPP55058 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLTPP55058 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLTPP55058 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PLTPP55058 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLTPP55058 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLTPP55058 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLTPP55058 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLTPP55058 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLTPP55058 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLTPP55058 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLTPP55058 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLTPP55058 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PLTPP55058 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PLTPP55058 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLTPP55058 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PLTPP55058 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLTPP55058 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLTPP55058 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLTPP55058 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLTPP55058 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLTPP55058 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLTPP55058 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLTPP55058 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLTPP55058 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLTPP55058 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLTPP55058 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLTPP55058 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLTPP55058 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLTPP55058 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLTPP55058 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLTPP55058 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLTPP55058 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLTPP55058 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLTPP55058 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms