Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PGGT1BP53609 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PGGT1BP53609 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PGGT1BP53609 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PGGT1BP53609 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PGGT1BP53609 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PGGT1BP53609 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PGGT1BP53609 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PGGT1BP53609 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGGT1BP53609 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGGT1BP53609 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGGT1BP53609 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGGT1BP53609 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGGT1BP53609 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGGT1BP53609 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGGT1BP53609 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGGT1BP53609 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGGT1BP53609 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PGGT1BP53609 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGGT1BP53609 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGGT1BP53609 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGGT1BP53609 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGGT1BP53609 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PGGT1BP53609 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGGT1BP53609 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGGT1BP53609 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGGT1BP53609 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGGT1BP53609 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGGT1BP53609 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGGT1BP53609 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGGT1BP53609 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGGT1BP53609 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGGT1BP53609 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGGT1BP53609 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGGT1BP53609 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PGGT1BP53609 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGGT1BP53609 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
PGGT1BP53609 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PGGT1BP53609 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PGGT1BP53609 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PGGT1BP53609 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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PGGT1BP53609 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PGGT1BP53609 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PGGT1BP53609 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
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PGGT1BP53609 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PGGT1BP53609 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PGGT1BP53609 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PGGT1BP53609 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
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PGGT1BP53609 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PGGT1BP53609 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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PGGT1BP53609 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PGGT1BP53609 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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PGGT1BP53609 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PGGT1BP53609 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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PGGT1BP53609 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PGGT1BP53609 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PGGT1BP53609 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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PGGT1BP53609 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PGGT1BP53609 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PGGT1BP53609 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PGGT1BP53609 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PGGT1BP53609 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PGGT1BP53609 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PGGT1BP53609 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PGGT1BP53609 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PGGT1BP53609 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PGGT1BP53609 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PGGT1BP53609 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PGGT1BP53609 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PGGT1BP53609 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PGGT1BP53609 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PGGT1BP53609 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PGGT1BP53609 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PGGT1BP53609 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PGGT1BP53609 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PGGT1BP53609 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PGGT1BP53609 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PGGT1BP53609 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PGGT1BP53609 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PGGT1BP53609 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PGGT1BP53609 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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