Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GBX2P52951 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GBX2P52951 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GBX2P52951 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GBX2P52951 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GBX2P52951 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GBX2P52951 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GBX2P52951 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GBX2P52951 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GBX2P52951 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GBX2P52951 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GBX2P52951 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GBX2P52951 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GBX2P52951 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GBX2P52951 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GBX2P52951 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GBX2P52951 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GBX2P52951 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GBX2P52951 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GBX2P52951 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GBX2P52951 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GBX2P52951 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBX2P52951 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBX2P52951 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBX2P52951 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBX2P52951 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBX2P52951 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBX2P52951 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBX2P52951 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBX2P52951 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBX2P52951 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBX2P52951 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBX2P52951 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBX2P52951 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBX2P52951 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBX2P52951 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBX2P52951 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBX2P52951 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBX2P52951 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBX2P52951 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBX2P52951 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBX2P52951 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBX2P52951 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBX2P52951 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GBX2P52951 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBX2P52951 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBX2P52951 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBX2P52951 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBX2P52951 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBX2P52951 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBX2P52951 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBX2P52951 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBX2P52951 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBX2P52951 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBX2P52951 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBX2P52951 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBX2P52951 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBX2P52951 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GBX2P52951 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBX2P52951 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBX2P52951 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBX2P52951 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBX2P52951 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBX2P52951 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBX2P52951 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBX2P52951 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBX2P52951 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBX2P52951 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBX2P52951 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBX2P52951 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBX2P52951 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBX2P52951 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBX2P52951 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBX2P52951 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBX2P52951 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBX2P52951 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBX2P52951 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBX2P52951 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBX2P52951 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBX2P52951 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBX2P52951 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBX2P52951 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GBX2P52951 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBX2P52951 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBX2P52951 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBX2P52951 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GBX2P52951 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBX2P52951 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBX2P52951 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBX2P52951 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBX2P52951 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBX2P52951 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBX2P52951 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GBX2P52951 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBX2P52951 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBX2P52951 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBX2P52951 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBX2P52951 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBX2P52951 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBX2P52951 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms