Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POU3F4P49335 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms