Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UTRNP46939 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UTRNP46939 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UTRNP46939 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UTRNP46939 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UTRNP46939 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UTRNP46939 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UTRNP46939 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UTRNP46939 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UTRNP46939 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UTRNP46939 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UTRNP46939 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UTRNP46939 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
UTRNP46939 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UTRNP46939 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UTRNP46939 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UTRNP46939 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UTRNP46939 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UTRNP46939 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UTRNP46939 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UTRNP46939 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UTRNP46939 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UTRNP46939 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
UTRNP46939 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
UTRNP46939 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UTRNP46939 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UTRNP46939 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UTRNP46939 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UTRNP46939 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UTRNP46939 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UTRNP46939 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UTRNP46939 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UTRNP46939 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UTRNP46939 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UTRNP46939 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
UTRNP46939 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UTRNP46939 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UTRNP46939 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UTRNP46939 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UTRNP46939 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UTRNP46939 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
UTRNP46939 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UTRNP46939 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UTRNP46939 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UTRNP46939 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UTRNP46939 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UTRNP46939 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UTRNP46939 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UTRNP46939 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UTRNP46939 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UTRNP46939 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UTRNP46939 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UTRNP46939 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UTRNP46939 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UTRNP46939 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UTRNP46939 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
UTRNP46939 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UTRNP46939 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UTRNP46939 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UTRNP46939 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UTRNP46939 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UTRNP46939 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UTRNP46939 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UTRNP46939 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UTRNP46939 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UTRNP46939 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UTRNP46939 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UTRNP46939 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UTRNP46939 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
UTRNP46939 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UTRNP46939 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UTRNP46939 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
UTRNP46939 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
UTRNP46939 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UTRNP46939 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UTRNP46939 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UTRNP46939 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UTRNP46939 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UTRNP46939 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UTRNP46939 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UTRNP46939 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UTRNP46939 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UTRNP46939 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UTRNP46939 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UTRNP46939 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UTRNP46939 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UTRNP46939 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UTRNP46939 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UTRNP46939 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
UTRNP46939 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UTRNP46939 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UTRNP46939 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UTRNP46939 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UTRNP46939 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UTRNP46939 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UTRNP46939 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
UTRNP46939 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UTRNP46939 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UTRNP46939 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UTRNP46939 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms