Protein–RNA interactions for Protein: P46087

NOP2, Probable 28S rRNA (cytosine(4447)-C(5))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP2P46087 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOP2P46087 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOP2P46087 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOP2P46087 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOP2P46087 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NOP2P46087 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOP2P46087 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOP2P46087 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOP2P46087 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOP2P46087 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOP2P46087 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOP2P46087 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOP2P46087 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOP2P46087 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOP2P46087 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOP2P46087 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOP2P46087 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOP2P46087 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOP2P46087 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOP2P46087 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOP2P46087 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NOP2P46087 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOP2P46087 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOP2P46087 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOP2P46087 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NOP2P46087 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOP2P46087 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOP2P46087 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOP2P46087 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOP2P46087 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOP2P46087 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOP2P46087 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOP2P46087 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOP2P46087 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOP2P46087 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOP2P46087 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOP2P46087 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOP2P46087 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOP2P46087 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOP2P46087 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOP2P46087 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOP2P46087 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NOP2P46087 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOP2P46087 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOP2P46087 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOP2P46087 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOP2P46087 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOP2P46087 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOP2P46087 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOP2P46087 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOP2P46087 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOP2P46087 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOP2P46087 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NOP2P46087 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOP2P46087 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOP2P46087 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOP2P46087 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOP2P46087 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOP2P46087 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NOP2P46087 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NOP2P46087 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NOP2P46087 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NOP2P46087 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NOP2P46087 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NOP2P46087 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NOP2P46087 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NOP2P46087 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NOP2P46087 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NOP2P46087 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NOP2P46087 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NOP2P46087 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NOP2P46087 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NOP2P46087 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NOP2P46087 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NOP2P46087 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NOP2P46087 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NOP2P46087 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NOP2P46087 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NOP2P46087 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOP2P46087 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOP2P46087 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOP2P46087 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOP2P46087 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOP2P46087 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOP2P46087 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOP2P46087 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOP2P46087 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOP2P46087 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NOP2P46087 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOP2P46087 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOP2P46087 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOP2P46087 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOP2P46087 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOP2P46087 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOP2P46087 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOP2P46087 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOP2P46087 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOP2P46087 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOP2P46087 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOP2P46087 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms