Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPD2P43304 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPD2P43304 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPD2P43304 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPD2P43304 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPD2P43304 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPD2P43304 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPD2P43304 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPD2P43304 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPD2P43304 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPD2P43304 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPD2P43304 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPD2P43304 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GPD2P43304 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPD2P43304 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPD2P43304 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPD2P43304 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPD2P43304 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPD2P43304 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPD2P43304 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPD2P43304 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPD2P43304 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPD2P43304 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPD2P43304 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPD2P43304 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPD2P43304 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPD2P43304 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPD2P43304 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPD2P43304 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPD2P43304 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPD2P43304 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPD2P43304 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPD2P43304 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPD2P43304 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPD2P43304 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPD2P43304 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPD2P43304 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPD2P43304 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPD2P43304 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPD2P43304 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPD2P43304 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPD2P43304 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPD2P43304 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPD2P43304 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPD2P43304 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GPD2P43304 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPD2P43304 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPD2P43304 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPD2P43304 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPD2P43304 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPD2P43304 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPD2P43304 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPD2P43304 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPD2P43304 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPD2P43304 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPD2P43304 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPD2P43304 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPD2P43304 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPD2P43304 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPD2P43304 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPD2P43304 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GPD2P43304 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPD2P43304 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPD2P43304 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPD2P43304 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPD2P43304 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPD2P43304 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPD2P43304 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPD2P43304 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPD2P43304 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPD2P43304 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPD2P43304 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPD2P43304 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPD2P43304 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GPD2P43304 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPD2P43304 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPD2P43304 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPD2P43304 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPD2P43304 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GPD2P43304 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPD2P43304 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPD2P43304 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPD2P43304 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPD2P43304 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPD2P43304 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPD2P43304 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPD2P43304 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPD2P43304 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPD2P43304 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPD2P43304 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPD2P43304 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GPD2P43304 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GPD2P43304 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.07
GPD2P43304 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPD2P43304 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPD2P43304 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPD2P43304 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPD2P43304 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPD2P43304 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPD2P43304 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms