Protein–RNA interactions for Protein: P42858

HTT, Huntingtin, humanhuman

Predictions only

Length 3,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTTP42858 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTTP42858 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTTP42858 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HTTP42858 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTTP42858 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTTP42858 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTTP42858 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTTP42858 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTTP42858 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTTP42858 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HTTP42858 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTTP42858 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTTP42858 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTTP42858 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTTP42858 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTTP42858 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HTTP42858 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTTP42858 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTTP42858 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HTTP42858 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HTTP42858 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTTP42858 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTTP42858 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTTP42858 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HTTP42858 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTTP42858 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTTP42858 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTTP42858 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTTP42858 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTTP42858 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTTP42858 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTTP42858 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTTP42858 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTTP42858 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HTTP42858 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTTP42858 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTTP42858 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTTP42858 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTTP42858 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTTP42858 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTTP42858 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTTP42858 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTTP42858 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTTP42858 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTTP42858 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTTP42858 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTTP42858 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTTP42858 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTTP42858 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTTP42858 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTTP42858 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTTP42858 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTTP42858 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTTP42858 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTTP42858 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTTP42858 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTTP42858 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HTTP42858 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTTP42858 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTTP42858 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTTP42858 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTTP42858 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTTP42858 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTTP42858 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTTP42858 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTTP42858 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HTTP42858 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTTP42858 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTTP42858 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTTP42858 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTTP42858 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTTP42858 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTTP42858 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTTP42858 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTTP42858 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTTP42858 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTTP42858 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HTTP42858 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTTP42858 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTTP42858 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTTP42858 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTTP42858 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HTTP42858 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTTP42858 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HTTP42858 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTTP42858 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTTP42858 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTTP42858 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTTP42858 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTTP42858 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTTP42858 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTTP42858 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTTP42858 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTTP42858 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTTP42858 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTTP42858 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HTTP42858 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTTP42858 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTTP42858 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTTP42858 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms