Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
APOBEC1P41238 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms