Protein–RNA interactions for Protein: P36578

RPL4, 60S ribosomal protein L4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL4P36578 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL4P36578 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL4P36578 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL4P36578 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL4P36578 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL4P36578 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL4P36578 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL4P36578 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL4P36578 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL4P36578 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL4P36578 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL4P36578 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL4P36578 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL4P36578 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPL4P36578 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPL4P36578 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPL4P36578 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RPL4P36578 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPL4P36578 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPL4P36578 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPL4P36578 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPL4P36578 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RPL4P36578 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPL4P36578 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPL4P36578 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPL4P36578 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPL4P36578 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPL4P36578 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPL4P36578 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPL4P36578 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPL4P36578 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPL4P36578 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPL4P36578 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPL4P36578 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPL4P36578 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPL4P36578 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPL4P36578 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPL4P36578 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPL4P36578 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPL4P36578 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPL4P36578 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPL4P36578 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPL4P36578 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPL4P36578 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPL4P36578 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPL4P36578 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
RPL4P36578 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
RPL4P36578 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPL4P36578 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPL4P36578 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPL4P36578 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPL4P36578 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPL4P36578 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPL4P36578 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPL4P36578 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPL4P36578 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPL4P36578 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPL4P36578 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPL4P36578 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPL4P36578 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPL4P36578 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPL4P36578 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPL4P36578 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPL4P36578 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPL4P36578 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
RPL4P36578 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPL4P36578 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPL4P36578 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPL4P36578 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPL4P36578 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPL4P36578 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPL4P36578 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPL4P36578 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPL4P36578 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPL4P36578 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPL4P36578 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPL4P36578 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPL4P36578 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPL4P36578 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPL4P36578 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPL4P36578 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPL4P36578 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPL4P36578 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPL4P36578 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPL4P36578 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RPL4P36578 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPL4P36578 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPL4P36578 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPL4P36578 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPL4P36578 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RPL4P36578 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPL4P36578 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPL4P36578 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPL4P36578 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPL4P36578 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
RPL4P36578 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPL4P36578 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPL4P36578 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPL4P36578 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPL4P36578 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms