Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms