Protein–RNA interactions for Protein: P26447

S100A4, Protein S100-A4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S100A4P26447 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
S100A4P26447 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
S100A4P26447 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
S100A4P26447 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
S100A4P26447 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
S100A4P26447 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
S100A4P26447 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
S100A4P26447 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
S100A4P26447 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
S100A4P26447 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
S100A4P26447 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
S100A4P26447 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
S100A4P26447 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
S100A4P26447 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
S100A4P26447 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
S100A4P26447 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
S100A4P26447 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
S100A4P26447 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
S100A4P26447 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
S100A4P26447 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
S100A4P26447 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
S100A4P26447 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
S100A4P26447 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
S100A4P26447 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
S100A4P26447 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
S100A4P26447 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
S100A4P26447 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
S100A4P26447 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
S100A4P26447 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
S100A4P26447 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
S100A4P26447 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
S100A4P26447 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
S100A4P26447 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
S100A4P26447 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
S100A4P26447 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
S100A4P26447 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
S100A4P26447 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
S100A4P26447 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
S100A4P26447 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
S100A4P26447 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
S100A4P26447 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
S100A4P26447 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
S100A4P26447 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
S100A4P26447 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
S100A4P26447 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
S100A4P26447 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
S100A4P26447 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
S100A4P26447 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
S100A4P26447 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
S100A4P26447 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
S100A4P26447 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
S100A4P26447 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
S100A4P26447 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
S100A4P26447 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
S100A4P26447 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
S100A4P26447 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
S100A4P26447 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
S100A4P26447 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
S100A4P26447 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
S100A4P26447 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
S100A4P26447 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
S100A4P26447 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
S100A4P26447 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
S100A4P26447 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
S100A4P26447 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
S100A4P26447 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
S100A4P26447 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
S100A4P26447 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
S100A4P26447 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
S100A4P26447 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
S100A4P26447 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
S100A4P26447 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
S100A4P26447 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
S100A4P26447 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
S100A4P26447 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
S100A4P26447 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
S100A4P26447 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
S100A4P26447 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
S100A4P26447 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
S100A4P26447 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
S100A4P26447 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
S100A4P26447 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
S100A4P26447 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
S100A4P26447 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
S100A4P26447 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
S100A4P26447 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
S100A4P26447 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
S100A4P26447 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
S100A4P26447 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
S100A4P26447 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
S100A4P26447 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
S100A4P26447 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
S100A4P26447 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
S100A4P26447 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
S100A4P26447 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
S100A4P26447 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
S100A4P26447 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
S100A4P26447 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
S100A4P26447 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
S100A4P26447 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms