Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR2AP24928 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms