Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPS6KB1P23443 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPS6KB1P23443 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms