Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
FGFR3P22607 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms