Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CD247P20963 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CD247P20963 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CD247P20963 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CD247P20963 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CD247P20963 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CD247P20963 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CD247P20963 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CD247P20963 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CD247P20963 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CD247P20963 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CD247P20963 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CD247P20963 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CD247P20963 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CD247P20963 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD247P20963 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD247P20963 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD247P20963 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD247P20963 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD247P20963 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD247P20963 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD247P20963 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD247P20963 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD247P20963 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CD247P20963 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD247P20963 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD247P20963 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD247P20963 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD247P20963 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD247P20963 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD247P20963 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD247P20963 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD247P20963 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD247P20963 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD247P20963 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD247P20963 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD247P20963 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD247P20963 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD247P20963 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD247P20963 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD247P20963 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD247P20963 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD247P20963 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CD247P20963 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CD247P20963 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CD247P20963 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CD247P20963 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CD247P20963 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CD247P20963 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CD247P20963 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CD247P20963 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CD247P20963 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CD247P20963 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CD247P20963 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CD247P20963 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CD247P20963 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CD247P20963 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CD247P20963 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CD247P20963 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CD247P20963 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CD247P20963 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CD247P20963 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CD247P20963 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CD247P20963 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CD247P20963 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CD247P20963 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CD247P20963 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CD247P20963 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CD247P20963 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CD247P20963 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CD247P20963 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CD247P20963 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CD247P20963 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CD247P20963 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CD247P20963 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CD247P20963 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CD247P20963 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CD247P20963 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CD247P20963 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CD247P20963 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CD247P20963 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CD247P20963 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CD247P20963 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CD247P20963 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CD247P20963 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CD247P20963 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
CD247P20963 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
CD247P20963 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CD247P20963 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CD247P20963 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CD247P20963 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CD247P20963 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CD247P20963 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CD247P20963 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CD247P20963 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CD247P20963 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CD247P20963 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CD247P20963 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CD247P20963 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CD247P20963 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms