Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMNB1P20700 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMNB1P20700 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMNB1P20700 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMNB1P20700 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMNB1P20700 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMNB1P20700 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMNB1P20700 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMNB1P20700 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LMNB1P20700 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMNB1P20700 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMNB1P20700 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMNB1P20700 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMNB1P20700 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMNB1P20700 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMNB1P20700 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LMNB1P20700 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMNB1P20700 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMNB1P20700 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LMNB1P20700 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMNB1P20700 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMNB1P20700 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMNB1P20700 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMNB1P20700 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMNB1P20700 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMNB1P20700 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMNB1P20700 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMNB1P20700 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMNB1P20700 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMNB1P20700 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMNB1P20700 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMNB1P20700 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LMNB1P20700 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMNB1P20700 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMNB1P20700 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMNB1P20700 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMNB1P20700 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMNB1P20700 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMNB1P20700 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMNB1P20700 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMNB1P20700 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMNB1P20700 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMNB1P20700 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMNB1P20700 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMNB1P20700 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMNB1P20700 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMNB1P20700 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMNB1P20700 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMNB1P20700 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMNB1P20700 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMNB1P20700 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMNB1P20700 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMNB1P20700 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMNB1P20700 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMNB1P20700 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMNB1P20700 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms