Protein–RNA interactions for Protein: P20337

RAB3B, Ras-related protein Rab-3B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3BP20337 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB3BP20337 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB3BP20337 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB3BP20337 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB3BP20337 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB3BP20337 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB3BP20337 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB3BP20337 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3BP20337 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3BP20337 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3BP20337 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3BP20337 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3BP20337 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3BP20337 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3BP20337 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3BP20337 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3BP20337 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3BP20337 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3BP20337 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3BP20337 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3BP20337 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3BP20337 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3BP20337 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3BP20337 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3BP20337 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3BP20337 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3BP20337 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3BP20337 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3BP20337 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3BP20337 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3BP20337 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3BP20337 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3BP20337 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3BP20337 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3BP20337 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3BP20337 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3BP20337 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3BP20337 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3BP20337 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3BP20337 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3BP20337 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3BP20337 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3BP20337 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3BP20337 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3BP20337 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3BP20337 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3BP20337 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3BP20337 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3BP20337 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3BP20337 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RAB3BP20337 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB3BP20337 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB3BP20337 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB3BP20337 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB3BP20337 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB3BP20337 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB3BP20337 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB3BP20337 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms