Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM21P19474 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms