Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIG1P18858 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIG1P18858 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIG1P18858 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LIG1P18858 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIG1P18858 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIG1P18858 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIG1P18858 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIG1P18858 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIG1P18858 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIG1P18858 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIG1P18858 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LIG1P18858 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LIG1P18858 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LIG1P18858 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LIG1P18858 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LIG1P18858 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LIG1P18858 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LIG1P18858 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LIG1P18858 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LIG1P18858 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LIG1P18858 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LIG1P18858 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LIG1P18858 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LIG1P18858 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LIG1P18858 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LIG1P18858 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIG1P18858 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIG1P18858 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIG1P18858 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIG1P18858 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIG1P18858 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIG1P18858 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIG1P18858 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIG1P18858 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIG1P18858 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIG1P18858 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIG1P18858 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIG1P18858 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIG1P18858 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIG1P18858 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIG1P18858 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIG1P18858 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIG1P18858 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIG1P18858 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIG1P18858 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LIG1P18858 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LIG1P18858 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LIG1P18858 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LIG1P18858 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LIG1P18858 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LIG1P18858 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LIG1P18858 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LIG1P18858 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LIG1P18858 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LIG1P18858 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LIG1P18858 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LIG1P18858 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LIG1P18858 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LIG1P18858 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LIG1P18858 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LIG1P18858 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LIG1P18858 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LIG1P18858 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LIG1P18858 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LIG1P18858 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LIG1P18858 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LIG1P18858 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LIG1P18858 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LIG1P18858 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LIG1P18858 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LIG1P18858 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LIG1P18858 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LIG1P18858 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LIG1P18858 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LIG1P18858 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LIG1P18858 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LIG1P18858 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LIG1P18858 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LIG1P18858 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LIG1P18858 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LIG1P18858 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LIG1P18858 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LIG1P18858 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LIG1P18858 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LIG1P18858 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LIG1P18858 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LIG1P18858 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LIG1P18858 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LIG1P18858 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LIG1P18858 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LIG1P18858 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LIG1P18858 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LIG1P18858 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LIG1P18858 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LIG1P18858 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LIG1P18858 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LIG1P18858 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LIG1P18858 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LIG1P18858 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms