Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
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