Protein–RNA interactions for Protein: P17676

CEBPB, CCAAT/enhancer-binding protein beta, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEBPBP17676 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEBPBP17676 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEBPBP17676 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CEBPBP17676 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CEBPBP17676 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEBPBP17676 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEBPBP17676 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEBPBP17676 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CEBPBP17676 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CEBPBP17676 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CEBPBP17676 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEBPBP17676 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms