Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMPD1P17405 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMPD1P17405 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms