Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms