Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.8 ms