Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NGFRP08138 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NGFRP08138 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NGFRP08138 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NGFRP08138 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NGFRP08138 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NGFRP08138 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NGFRP08138 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NGFRP08138 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NGFRP08138 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NGFRP08138 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NGFRP08138 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NGFRP08138 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NGFRP08138 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NGFRP08138 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NGFRP08138 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NGFRP08138 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NGFRP08138 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NGFRP08138 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NGFRP08138 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NGFRP08138 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NGFRP08138 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NGFRP08138 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NGFRP08138 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NGFRP08138 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NGFRP08138 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NGFRP08138 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NGFRP08138 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NGFRP08138 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NGFRP08138 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NGFRP08138 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NGFRP08138 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NGFRP08138 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NGFRP08138 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NGFRP08138 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NGFRP08138 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NGFRP08138 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NGFRP08138 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NGFRP08138 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NGFRP08138 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NGFRP08138 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NGFRP08138 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NGFRP08138 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NGFRP08138 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NGFRP08138 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NGFRP08138 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NGFRP08138 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NGFRP08138 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NGFRP08138 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NGFRP08138 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NGFRP08138 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NGFRP08138 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NGFRP08138 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NGFRP08138 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NGFRP08138 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NGFRP08138 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NGFRP08138 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NGFRP08138 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NGFRP08138 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NGFRP08138 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NGFRP08138 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NGFRP08138 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NGFRP08138 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NGFRP08138 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NGFRP08138 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NGFRP08138 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NGFRP08138 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NGFRP08138 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NGFRP08138 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NGFRP08138 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NGFRP08138 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NGFRP08138 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NGFRP08138 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NGFRP08138 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NGFRP08138 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NGFRP08138 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NGFRP08138 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NGFRP08138 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NGFRP08138 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NGFRP08138 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NGFRP08138 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NGFRP08138 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NGFRP08138 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NGFRP08138 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NGFRP08138 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NGFRP08138 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NGFRP08138 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NGFRP08138 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NGFRP08138 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NGFRP08138 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NGFRP08138 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NGFRP08138 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NGFRP08138 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NGFRP08138 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NGFRP08138 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NGFRP08138 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NGFRP08138 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NGFRP08138 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NGFRP08138 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NGFRP08138 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms