Protein–RNA interactions for Protein: P05549

TFAP2A, Transcription factor AP-2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP2AP05549 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFAP2AP05549 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms