Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOC1P02654 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOC1P02654 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOC1P02654 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOC1P02654 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOC1P02654 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
APOC1P02654 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOC1P02654 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOC1P02654 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOC1P02654 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
APOC1P02654 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
APOC1P02654 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
APOC1P02654 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOC1P02654 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOC1P02654 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
APOC1P02654 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
APOC1P02654 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOC1P02654 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOC1P02654 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
APOC1P02654 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOC1P02654 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
APOC1P02654 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOC1P02654 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOC1P02654 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOC1P02654 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOC1P02654 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOC1P02654 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOC1P02654 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOC1P02654 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOC1P02654 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOC1P02654 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOC1P02654 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOC1P02654 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOC1P02654 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOC1P02654 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
APOC1P02654 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOC1P02654 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOC1P02654 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOC1P02654 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOC1P02654 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOC1P02654 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
APOC1P02654 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOC1P02654 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOC1P02654 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOC1P02654 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOC1P02654 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOC1P02654 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOC1P02654 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOC1P02654 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOC1P02654 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOC1P02654 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOC1P02654 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOC1P02654 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOC1P02654 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOC1P02654 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOC1P02654 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOC1P02654 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOC1P02654 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOC1P02654 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
APOC1P02654 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOC1P02654 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOC1P02654 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOC1P02654 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOC1P02654 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOC1P02654 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOC1P02654 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC1P02654 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC1P02654 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC1P02654 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC1P02654 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC1P02654 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC1P02654 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC1P02654 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC1P02654 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC1P02654 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC1P02654 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC1P02654 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC1P02654 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC1P02654 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC1P02654 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC1P02654 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC1P02654 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC1P02654 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC1P02654 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC1P02654 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC1P02654 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC1P02654 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC1P02654 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOC1P02654 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOC1P02654 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOC1P02654 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOC1P02654 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOC1P02654 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOC1P02654 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOC1P02654 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOC1P02654 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOC1P02654 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
APOC1P02654 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOC1P02654 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOC1P02654 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms