Protein–RNA interactions for Protein: O95976

IGSF6, Immunoglobulin superfamily member 6, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF6O95976 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IGSF6O95976 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IGSF6O95976 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IGSF6O95976 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IGSF6O95976 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IGSF6O95976 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IGSF6O95976 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IGSF6O95976 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IGSF6O95976 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IGSF6O95976 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IGSF6O95976 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IGSF6O95976 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IGSF6O95976 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IGSF6O95976 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IGSF6O95976 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IGSF6O95976 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IGSF6O95976 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
IGSF6O95976 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IGSF6O95976 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IGSF6O95976 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IGSF6O95976 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IGSF6O95976 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IGSF6O95976 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
IGSF6O95976 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IGSF6O95976 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IGSF6O95976 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IGSF6O95976 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IGSF6O95976 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IGSF6O95976 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IGSF6O95976 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IGSF6O95976 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IGSF6O95976 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IGSF6O95976 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IGSF6O95976 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IGSF6O95976 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IGSF6O95976 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IGSF6O95976 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IGSF6O95976 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IGSF6O95976 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IGSF6O95976 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IGSF6O95976 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
IGSF6O95976 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IGSF6O95976 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IGSF6O95976 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IGSF6O95976 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IGSF6O95976 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IGSF6O95976 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IGSF6O95976 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IGSF6O95976 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IGSF6O95976 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IGSF6O95976 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IGSF6O95976 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IGSF6O95976 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IGSF6O95976 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IGSF6O95976 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IGSF6O95976 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IGSF6O95976 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IGSF6O95976 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IGSF6O95976 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IGSF6O95976 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IGSF6O95976 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IGSF6O95976 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IGSF6O95976 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IGSF6O95976 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IGSF6O95976 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IGSF6O95976 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IGSF6O95976 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IGSF6O95976 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IGSF6O95976 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IGSF6O95976 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
IGSF6O95976 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IGSF6O95976 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IGSF6O95976 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IGSF6O95976 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IGSF6O95976 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IGSF6O95976 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IGSF6O95976 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
IGSF6O95976 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
IGSF6O95976 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
IGSF6O95976 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
IGSF6O95976 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
IGSF6O95976 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
IGSF6O95976 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
IGSF6O95976 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
IGSF6O95976 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IGSF6O95976 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
IGSF6O95976 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IGSF6O95976 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
IGSF6O95976 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
IGSF6O95976 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IGSF6O95976 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
IGSF6O95976 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IGSF6O95976 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IGSF6O95976 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IGSF6O95976 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IGSF6O95976 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IGSF6O95976 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IGSF6O95976 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IGSF6O95976 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IGSF6O95976 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms