Protein–RNA interactions for Protein: O43852

CALU, Calumenin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALUO43852 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CALUO43852 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CALUO43852 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CALUO43852 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CALUO43852 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CALUO43852 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CALUO43852 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALUO43852 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALUO43852 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALUO43852 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALUO43852 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALUO43852 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALUO43852 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALUO43852 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALUO43852 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALUO43852 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALUO43852 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALUO43852 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALUO43852 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALUO43852 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CALUO43852 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CALUO43852 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALUO43852 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALUO43852 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CALUO43852 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALUO43852 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALUO43852 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALUO43852 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALUO43852 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALUO43852 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CALUO43852 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CALUO43852 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALUO43852 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALUO43852 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CALUO43852 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALUO43852 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALUO43852 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALUO43852 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALUO43852 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALUO43852 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALUO43852 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALUO43852 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALUO43852 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALUO43852 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALUO43852 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALUO43852 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALUO43852 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALUO43852 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALUO43852 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALUO43852 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALUO43852 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALUO43852 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CALUO43852 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALUO43852 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALUO43852 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALUO43852 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALUO43852 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALUO43852 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALUO43852 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALUO43852 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALUO43852 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALUO43852 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALUO43852 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALUO43852 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALUO43852 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALUO43852 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALUO43852 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALUO43852 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALUO43852 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALUO43852 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALUO43852 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALUO43852 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALUO43852 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALUO43852 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CALUO43852 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CALUO43852 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALUO43852 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALUO43852 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALUO43852 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CALUO43852 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CALUO43852 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CALUO43852 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CALUO43852 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CALUO43852 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CALUO43852 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CALUO43852 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CALUO43852 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CALUO43852 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CALUO43852 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CALUO43852 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CALUO43852 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CALUO43852 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CALUO43852 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CALUO43852 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CALUO43852 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CALUO43852 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CALUO43852 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CALUO43852 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CALUO43852 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CALUO43852 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms