Protein–RNA interactions for Protein: O43439

CBFA2T2, Protein CBFA2T2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFA2T2O43439 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBFA2T2O43439 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBFA2T2O43439 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBFA2T2O43439 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBFA2T2O43439 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBFA2T2O43439 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBFA2T2O43439 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBFA2T2O43439 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBFA2T2O43439 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBFA2T2O43439 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBFA2T2O43439 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBFA2T2O43439 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBFA2T2O43439 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBFA2T2O43439 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBFA2T2O43439 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBFA2T2O43439 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBFA2T2O43439 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBFA2T2O43439 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBFA2T2O43439 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBFA2T2O43439 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBFA2T2O43439 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBFA2T2O43439 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBFA2T2O43439 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBFA2T2O43439 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBFA2T2O43439 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBFA2T2O43439 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBFA2T2O43439 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBFA2T2O43439 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBFA2T2O43439 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBFA2T2O43439 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBFA2T2O43439 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBFA2T2O43439 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBFA2T2O43439 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBFA2T2O43439 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBFA2T2O43439 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBFA2T2O43439 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBFA2T2O43439 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBFA2T2O43439 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBFA2T2O43439 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBFA2T2O43439 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBFA2T2O43439 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBFA2T2O43439 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBFA2T2O43439 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBFA2T2O43439 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBFA2T2O43439 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBFA2T2O43439 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBFA2T2O43439 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBFA2T2O43439 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBFA2T2O43439 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBFA2T2O43439 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBFA2T2O43439 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBFA2T2O43439 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBFA2T2O43439 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CBFA2T2O43439 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBFA2T2O43439 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBFA2T2O43439 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBFA2T2O43439 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBFA2T2O43439 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBFA2T2O43439 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBFA2T2O43439 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBFA2T2O43439 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBFA2T2O43439 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBFA2T2O43439 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CBFA2T2O43439 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CBFA2T2O43439 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CBFA2T2O43439 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms