Protein–RNA interactions for Protein: O15511

ARPC5, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC5O15511 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARPC5O15511 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARPC5O15511 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARPC5O15511 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARPC5O15511 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ARPC5O15511 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ARPC5O15511 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARPC5O15511 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms