Protein–RNA interactions for Protein: O15504

NUPL2, Nucleoporin-like protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPL2O15504 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NUPL2O15504 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUPL2O15504 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUPL2O15504 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUPL2O15504 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NUPL2O15504 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUPL2O15504 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUPL2O15504 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUPL2O15504 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUPL2O15504 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUPL2O15504 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUPL2O15504 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUPL2O15504 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUPL2O15504 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUPL2O15504 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUPL2O15504 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUPL2O15504 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUPL2O15504 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUPL2O15504 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUPL2O15504 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUPL2O15504 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUPL2O15504 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUPL2O15504 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUPL2O15504 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUPL2O15504 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUPL2O15504 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NUPL2O15504 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms