Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPRTO14522 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPRTO14522 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPRTO14522 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPRTO14522 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPRTO14522 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPRTO14522 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPRTO14522 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPRTO14522 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPRTO14522 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPRTO14522 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPRTO14522 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPRTO14522 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTPRTO14522 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTPRTO14522 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTPRTO14522 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTPRTO14522 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTPRTO14522 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTPRTO14522 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTPRTO14522 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTPRTO14522 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTPRTO14522 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTPRTO14522 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTPRTO14522 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTPRTO14522 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTPRTO14522 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPRTO14522 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPRTO14522 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPRTO14522 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPRTO14522 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPRTO14522 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPRTO14522 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPRTO14522 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPRTO14522 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPRTO14522 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPRTO14522 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPRTO14522 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPRTO14522 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PTPRTO14522 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PTPRTO14522 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PTPRTO14522 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PTPRTO14522 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PTPRTO14522 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PTPRTO14522 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PTPRTO14522 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PTPRTO14522 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PTPRTO14522 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
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