Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HIP1O00291 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HIP1O00291 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HIP1O00291 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HIP1O00291 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HIP1O00291 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HIP1O00291 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HIP1O00291 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HIP1O00291 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HIP1O00291 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HIP1O00291 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HIP1O00291 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HIP1O00291 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HIP1O00291 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HIP1O00291 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HIP1O00291 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HIP1O00291 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HIP1O00291 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HIP1O00291 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HIP1O00291 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HIP1O00291 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HIP1O00291 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HIP1O00291 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HIP1O00291 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HIP1O00291 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HIP1O00291 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HIP1O00291 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HIP1O00291 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HIP1O00291 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HIP1O00291 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HIP1O00291 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HIP1O00291 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HIP1O00291 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HIP1O00291 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HIP1O00291 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HIP1O00291 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HIP1O00291 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HIP1O00291 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HIP1O00291 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HIP1O00291 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HIP1O00291 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HIP1O00291 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HIP1O00291 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HIP1O00291 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HIP1O00291 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HIP1O00291 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HIP1O00291 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HIP1O00291 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HIP1O00291 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HIP1O00291 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HIP1O00291 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HIP1O00291 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HIP1O00291 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HIP1O00291 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HIP1O00291 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HIP1O00291 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HIP1O00291 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HIP1O00291 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HIP1O00291 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HIP1O00291 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HIP1O00291 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HIP1O00291 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HIP1O00291 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HIP1O00291 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HIP1O00291 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HIP1O00291 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HIP1O00291 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HIP1O00291 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HIP1O00291 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HIP1O00291 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HIP1O00291 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HIP1O00291 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HIP1O00291 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HIP1O00291 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HIP1O00291 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HIP1O00291 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HIP1O00291 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HIP1O00291 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HIP1O00291 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HIP1O00291 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HIP1O00291 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HIP1O00291 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HIP1O00291 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HIP1O00291 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HIP1O00291 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HIP1O00291 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HIP1O00291 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HIP1O00291 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HIP1O00291 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HIP1O00291 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HIP1O00291 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HIP1O00291 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HIP1O00291 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HIP1O00291 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HIP1O00291 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HIP1O00291 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HIP1O00291 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HIP1O00291 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HIP1O00291 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HIP1O00291 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms