Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
HMGB1P1B2RPK0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HMGB1P1B2RPK0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms