Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00587B1AMM8 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms