Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC160A6NGH7 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms