Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LAMB4A4D0S4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LAMB4A4D0S4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LAMB4A4D0S4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LAMB4A4D0S4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LAMB4A4D0S4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LAMB4A4D0S4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LAMB4A4D0S4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LAMB4A4D0S4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LAMB4A4D0S4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LAMB4A4D0S4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LAMB4A4D0S4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LAMB4A4D0S4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LAMB4A4D0S4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LAMB4A4D0S4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LAMB4A4D0S4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LAMB4A4D0S4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LAMB4A4D0S4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
LAMB4A4D0S4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LAMB4A4D0S4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LAMB4A4D0S4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LAMB4A4D0S4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LAMB4A4D0S4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
LAMB4A4D0S4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LAMB4A4D0S4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LAMB4A4D0S4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LAMB4A4D0S4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LAMB4A4D0S4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LAMB4A4D0S4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LAMB4A4D0S4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LAMB4A4D0S4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LAMB4A4D0S4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LAMB4A4D0S4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LAMB4A4D0S4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LAMB4A4D0S4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LAMB4A4D0S4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
LAMB4A4D0S4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LAMB4A4D0S4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
LAMB4A4D0S4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LAMB4A4D0S4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LAMB4A4D0S4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LAMB4A4D0S4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LAMB4A4D0S4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LAMB4A4D0S4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LAMB4A4D0S4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LAMB4A4D0S4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LAMB4A4D0S4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LAMB4A4D0S4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LAMB4A4D0S4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LAMB4A4D0S4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LAMB4A4D0S4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LAMB4A4D0S4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LAMB4A4D0S4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LAMB4A4D0S4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LAMB4A4D0S4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LAMB4A4D0S4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LAMB4A4D0S4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LAMB4A4D0S4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LAMB4A4D0S4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LAMB4A4D0S4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LAMB4A4D0S4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LAMB4A4D0S4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LAMB4A4D0S4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LAMB4A4D0S4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LAMB4A4D0S4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LAMB4A4D0S4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LAMB4A4D0S4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LAMB4A4D0S4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LAMB4A4D0S4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LAMB4A4D0S4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LAMB4A4D0S4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LAMB4A4D0S4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LAMB4A4D0S4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LAMB4A4D0S4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LAMB4A4D0S4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LAMB4A4D0S4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LAMB4A4D0S4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LAMB4A4D0S4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LAMB4A4D0S4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LAMB4A4D0S4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LAMB4A4D0S4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LAMB4A4D0S4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LAMB4A4D0S4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LAMB4A4D0S4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LAMB4A4D0S4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LAMB4A4D0S4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LAMB4A4D0S4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LAMB4A4D0S4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LAMB4A4D0S4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LAMB4A4D0S4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LAMB4A4D0S4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LAMB4A4D0S4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LAMB4A4D0S4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LAMB4A4D0S4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LAMB4A4D0S4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LAMB4A4D0S4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LAMB4A4D0S4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LAMB4A4D0S4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LAMB4A4D0S4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LAMB4A4D0S4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms