Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNX8Q9Y5X2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX8Q9Y5X2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms