Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SH3BP1Q9Y3L3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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